日本农林水产省计划以2016年为目标，制定新的农产品安全保证认证制度。新制度将大幅强化现行制度的审查体制，力争通过食品安全的国际组织“GFSI”认证。约有400家经销食品的跨国性企业参加该组织，日本认为这有利于交易。日本将强调生产安全性，以达到2020年农林水产品出口增至目前1.6倍达1万亿日元的目标。

农产品安全性认证的系统被称为农业生产工程管理（GAP）。日本有叫做“JGAP”的系统。根据调查农户或农场的申请，调查水、肥料安全性保障对策、从收获到上市的卫生管理体制等，并予以认证。但因未达到食品安全的国际组织“全球食品安全倡议（GFSI）”的认证标准，JGAP在海外市场的宣传很弱。因此日本农林水产省准备制定名为“出口用GAP（暂定）”的符合GFSI标准的新认证制度据贸易统计，2014年日本农林水产品、食品的出口额创历史最高，为6117亿元。但是其中面向香港和泰国等亚洲国家的出口超过70%，面向欧美的出口却只占20%左右。日本将以国际认可的认证制度为杠杆，开拓薄弱的欧美市场，力争2020年达成出口1万亿日元的目标。